En el marco de una causa por calumnias e injurias que había sido iniciada por un funcionario de la Secretaría de Inteligencia del Estado (SIDE), la Cámara en lo Criminal y Correccional Federal hizo lugar al pedido de recusación del juez Claudio Bonadío, planteado por el director y el presidente del directorio de La Nación  S.A. Los jueces que componen la Sala I, decidieron avalar el pedido efectuado por Bartolomé Mitre y Julio Saguier, director y presidente del directorio de La Nación S.A., respectivamente, en una causa en la que un funcionario de la SIDE llamado Antonio Horacio Stiuso les había iniciado por calumnias e injurias. Sosteniendo que “emitieron opiniones críticas desde la editorial del diario La Nación contra el magistrado entre las que se encuentran aquellas que se relacionan con la causa conocida como ‘irregularidades de la investigación AMIA’ que se vinculan con el objeto procesal de la querella que se les ha entablado en este proceso; a que también en esa causa el Dr. Bonadío resultó ser imputado; y, por último, a una serie de actos realizados por el a quo en estas actuaciones vinculadas con la fecha y domicilio de la notificación de la querella”, los acusados argumentaron su decisión de recurrir al magistrado, según fue publicado por el Centro de Información Judicial. El funcionario de la SIDE entabló dicha demanda contra el director y el presidente del directorio de la compañía, luego de que en su diario, se hubiesen referido a su persona como “autor de hechos graves relacionados con el atentado a la sede de la AMIA”, así como “acusado por la justicia de las irregularidades advertidas por el Tribunal Oral Federal Nro. 3 en la instrucción de la llamada Causa AMIA”.